《粤港澳大湾区发展规划纲要》将中医药科技产业发展定位为大湾区和粤澳合作的重大创新载体。中医药产业作为澳门推动多元经济发展的支柱产业，已经成为澳门特区政府首个五年规划以及参与国家一带一路建设的重要举措。中医药治疗也在本次抗击新冠病毒疫情中展现出独特的优势。为此，大学结合中药质量研究国家重点实验室、中医药学院、药学院、医学院和科大医院等学科完善的医药体系，创立「澳门创新中药与产业化技术创新中心」。
- 中药质量检定中心：基于大学现有的ISO 17025认证实验室和ISO中医药技术委员会（澳科大为该委员会中药材工作组主席和秘书处单位）研发的中药ISO国际标准，依托中药质量研究国家重点实验室，建立面向出口中药的国际认可质量检定体系，涵盖中药生产全过程的产品，包括中药原药材、传统及新型饮片、配方颗粒剂、中药提取物、中成药等，根据国际认可的中药ISO国际标准或欧美国家标准等进行检定，为合格样品颁发优质中药认证标志，打通中药出口质量认证的关键环节，形成澳门优质中药认证品牌，并以此为契机在澳门逐渐形成优质中药的物流、集散、出口、交易、期货中心，推动澳门中药产业的发展。
- 创新中药研发中心：充分利用澳门立法中成药注册的契机，针对严重影响人类健康的多发疾病、常见疾病、危重疾病、突发疾病等，采用先进的中药制剂技术、新型药物辅料和质量评价体系，推动临床有效的系列经典名方快速成药化研究和药品注册；利用中药质量研究国家重点实验室的创新药物研究发技术平台，对其开展物质基础和作用机理的系统研究，发现具有良好成药性前景的中药提取物、中药单体成分及其组合物，进行药学研究、药效学研究、安全性评价等系统的临床前研究，形成基于有效经典名方的系列创新中药。
创新中药产业孵化中心：通过设立基金等方式资助大学研发的中药方剂和创新中药产业化，尤其鼓励与澳门本地的初创药企合作；建立中药中试车间，与横琴粤澳中医药产业园开展成果转化合作；以及联合科大医院等医疗机构进行临床试验，完成创新药物的药品注册；设立跨境药物注册及销售工作小组，研究并推动澳门注册的中药经典名方制剂和创新中药在国际，尤其是一带一路沿线国家和葡语系国家注册或销售的政策和机制，拓宽中药国际市场，推动澳门中成药产业的发展壮大。